Simulasi Molecular Docking Aktivitas Antiinflamasi Rimpang Zingiber Officinale var. amarum pada Mediator Inflamasi Prostaglandin D2 (PGD2) dan Tromboksan A2 (TXA2) pada Osteoarthritis

Authors

  • Denis Mery Mirza
  • Erna Sulistyowati
  • Anta Maulana Fardhani

DOI:

https://doi.org/10.33474/jki.v13i1.21779

Abstract

Abstract. Osteoarthritis (OA) is a degenerative joint disease characterized by damage to joint cartilage, subchondral bone, and osteophyte formation. The prevalence of OA is still large with major therapy is non steroid anti inflammatori (NSAID) drug. However, prolonged use of NSAIDs leads to side effects on gastrointestinal tract. Zingiber officinale var. amarum is beneficial herbal for anti-inflammatory therapy in OA. The damage of chondrocytes in OA triggers the activation of inflammatory process through the COX-2 pathway, resulting in the production of chemical mediators prostaglandin D2 (PGD2) and thromboxane A2 (TXA2), causing pain and functional decline. Thus, this research aimed to predict active compounds of Z. officinale var. amarum rhizomes that potential to inhibit PGD2 and TXA2 as anti-inflammatory agents for OA through molecular docking. Method This research use 20 active compounds of Z. officinale var. amarum using molecular docking method with proteins target including of PGD2 (ID:1S2A) and TXA2 (ID:6IIV). The docking process was conducted using the PyRX

0.8 application, and the results were visualized in the BIOVIA Discovery Studio 2020 application. Result the research on the 20 active compounds in the rhizome of Z. officinale var. amarum indicates that compounds such as [6]-Gingerdiol 3,5-diacetate, 10-gingerol, gingerdione, and gingerdiol can interact with the active site of the protein 1S2A through hydrogen bonding with Gln-222. Furthermore, compounds like [6]- dehydrogingerdione, paradol, gingerdiol, geraniol, 10-gingerol, gingerdione, [6]- Gingerdiol 3,5-diacetate, isoborneol, zingerone have been identified to interact with 6IIV through hydrogen bonding with Gln-301 and Thr-81. This indicates that these compounds exhibit activity as inhibitors of PGD2 and TXA2. The interactions occurring between the complex compounds of Z. officinale var. amarum and 1S2A and 6IIV can lead to inhibitory effects on PGD2 and TXA2.

 

Kata Kunci:

molecular docking; osteoarthritis; PGD2; TXA2; Z. officinale var. amarum

Downloads

Published

2024-05-14

Issue

Vol. 13 No. 1 (2024): Jurnal Kesehatan Islam : Islamic Health Journal

Section

Jurnal Kesehatan Islam

License

Copyright (c) 2024 Denis Mery Mirza, Erna Sulistyowati, Anta Maulana Fardhani

Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Jurnal Kesehatan Islam : Islamic Health Journal dengan nomor registrasi ISSN  2303-002X  (cetak)  2615-8345  (online)  yang diterbitkan oleh Fakultas Kedokteran Universitas Islam Malang menerapkan ketentuan Hak Cipta dan Lisensi sebagai berikut:

 

Hak cipta:

  • Hak Cipta pada setiap naskah adalah milik penulis.
  • Penulis mengakui bahwa Jurnal Kesehatan Islam : Islamic Health Journal berhak sebagai yang pertama kali mempublikasikan dengan lisensi Creative Commons Attributions-ShareAlike 4.0 International License.
  • Penulis dapat memasukan tulisan secara terpisah, mengatur distribusi non-ekskulif dari naskah yang telah terbit di jurnal ini kedalam versi yang lain dengan mengakui bahwa naskah telah terbit pertama kali pada Jurnal Kesehatan Islam : Islamic Health Journal.

 

Lisensi:

  • Atribusi: Anda harus mencantumkan nama yang sesuai, mencantumkan tautan terhadap lisensi, dan menyatakan bahwa telah ada perubahan yang dilakukan. Anda dapat melakukan hal ini dengan cara yang sesuai, namun tidak mengisyaratkan bahwa pemberi lisensi mendukung Anda atau penggunaan Anda.
  • Berbagi Serupa: Apabila Anda menggubah atau membuat turunan dari materi ini, Anda harus menyebarluaskan kontribusi Anda di bawah lisensi yang sama dengan materi asli.
  • Tidak ada batasan tambahan: Anda tidak dapat menggunakan ketentuan hukum atau sarana kontrol teknologi yang secara hukum membatasi orang lain untuk melakukan hal-hal yang diizinkan lisensi ini.

Anda bebas untuk:

  • Berbagi menyalin dan menyebarluaskan kembali materi ini dalam bentuk atau format apapun.
  • Beradaptasi mengubah dan membuat turunan dari materi ini untuk kepentingan apapun, termasuk kepentingan komersial.
  • Pemberi lisensi tidak dapat mencabut ketentuan di atas sepanjang Anda mematuhi ketentuan lisensi ini.